手術療效通常分近期和遠期療效兩種。
近期療效主要是以出院時神經功能狀況來判斷， 如有無偏癱、失語、偏身感覺異常、術前症狀的改善情況以及術後早期CT、MRI、DSA等影像學檢查結果。 然而， 這些結果並不能反映患者的遠期療效， 如術後半年、1年或更長時間的預後。
時間還短， 再觀察觀察。
臨床上， 常發現術後出現的偏癱、失語， 1~2年後肢體肌力基本恢復正常、言語流利。 另一方面， 患者術後的症狀改善也需要一個過程， 如癲癇是否控制， 視力是否好轉， 認知功能是否恢復等均需通過隨訪才知道。
此外， 判斷顱內腫瘤切除程度通常是以術中鏡下所見和術後CT和/或MRI所示為依據，
寰枕畸形內固定手術穩定性， 有些學者只是以出院時的影像學來判斷， 但不能得出長期穩定的結論， 因術後穩定性受多種因素影響， 如骨質疏鬆、頸部過度活動等。 因此， 術後隨訪尤其是長期隨訪才能準確判斷手術療效。
顱腦損傷術後療效判斷， 有些學者只是以出院時的GOS評分、日常生活能力評分來判斷療效， 其實是不科學的， 因為神經系統的功能恢復慢但潛力大， 因此判斷其療效至少要隨訪6月。
術後併發症有時在出院後甚至1年或更長時間才出現， 如術後顱內感染， 經單鼻孔蝶竇入路垂體腺瘤切除術後腦脊液鼻漏、術後腦積水、術後癲癇等， 隨訪可及時發現並治療這些併發症。
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