在寶可夢系列動畫中， 火箭隊作為系列主要的反派角色之一， 雖然在劇情中， 他們大多都會做一些「傷天害理」的事情。 然而在不少場合， 他們也會流露出自己善良的一面， 尤其是在與寶可夢分別的時候。 下面就一起來看看吧~
01 告別大舌頭在無印動畫系列的第147集《果然翁與寶可夢交換大會》中， 葉之鎮舉辦了寶可夢交換會， 武藏的大舌頭意外被交換為果然翁。
劇情回顧
聽說了葉之鎮有寶可夢交換會， 小智一行人決定去看一看。 在那裡， 小智贏得了肯泰羅大戰。 他們新認識的訓練家阿德想和別人交換自己的果然翁， 但是一直沒有人願意交換。
與此同時， 火箭隊在使用假的寶可夢交換機騙取訓練家們的寶可夢。 果然翁能否成功交換？火箭隊的陰謀又會如何繼續呢？
主要事件
小智一行人來到葉之鎮參加肯泰羅大戰與寶可夢交換大會。 小智從大木博士那將赫拉克羅斯交換為肯泰羅， 並參加肯泰羅大戰。 小智在肯泰羅大戰打敗光仔。 武藏的大舌頭意外被交換為果然翁。 02 告別大食花在無印動畫系列的第262集《奈奈與電擊怪！》中， 小智一行人在森林中發現了一隻電擊怪， 對戰中小次郎被迫放棄了他第二隻進化來的大食花。
劇情回顧
小智一行人在森林中發現了一隻電擊怪。 火箭隊三人組突襲小智將幼基拉斯和電擊怪抓走。 正當小智一行人追逐火箭隊時， 他們遇見了小智的一位勁敵奈奈， 她在叢林裡尋找那只電擊怪。 得知電擊怪被火箭隊抓走後，
另一邊， 電擊怪帶著幼基拉斯從火箭隊的氣球上逃了下來， 火箭隊在尋找兩隻寶可夢的時候遇見了鯉魚王阿貝， 小次郎被迫拿出大食花去跟鯉魚王阿貝交換會使用甜甜香氣的口呆花以引誘寶可夢。
主要事件
小智一行人再次遇見奈奈， 並看見奈奈的月桂葉已經進化為大竺葵。 小次郎用大食花與鯉魚王阿貝的口呆花交換。 小次郎新交換來的口呆花進化為大食花。 小次郎和鯉魚王阿貝分別將大食花放歸野生環境， 兩隻大食花相愛。 奈奈收服了電擊怪。 03 告別雙彈瓦斯與阿柏怪在超世代動畫系列的第6集《火箭隊！亂抓， 再見了！》中， 火箭隊一行為了對抗寶可夢獵人， 含淚告別了雙彈瓦斯與阿柏怪。
劇情回顧
前往卡那茲市的小智一行人來到一座森林，聽說最近這一帶目無法紀的寶可夢盜獵者很倡狂。由於發現了盜獵者使用的捕獲網的一部份，小智一行人遂加入幫忙君莎小姐追捕犯人。
火箭隊三人組偶然發現寶可夢獵人阿隆抓到的大量有毒寶可夢阿柏蛇與瓦斯彈，原來他是受雇傭來捕捉毒屬性寶可夢的。由於長期以來的好搭擋阿柏怪與雙彈瓦斯就是由阿柏蛇和瓦斯彈進化而來，對這兩種寶可夢有深厚感情的火箭隊，下定決心要救出這群寶可夢並把它們收為同伴。
但是這個行動被盜獵者阿隆發現，火箭隊的阿柏怪與雙彈瓦斯也成了他想要捕捉的目標！面對使用實力強大的寶可夢大嘴雀、班基拉斯的阿隆，火箭隊完全無反抗能力！但是喵喵頂著強力的高壓電擊拼命放出了所有的瓦斯彈和阿柏蛇，並且由武藏和小次郎拼死拖住阿隆的行動，讓雙彈瓦斯和阿柏怪保護大家迅速逃跑。
阿隆打倒了火箭隊，試圖重新捕捉逃走的阿柏蛇和瓦斯彈，但被趕來的小智一行人和君莎小姐截住，君莎小姐命令阿隆立即釋放盜獵得來的寶可夢，阿隆惱怒地說那些寶可夢早已被其他人救走了，小智感慨這個世界還是好人更多。
告別了阿柏怪和雙彈瓦斯的火箭隊三人組走在森林中，仍念念不忘它們能否保護好自己的同伴。這時之前在他們被一群大針蜂圍攻時伸出援手的那只刺球仙人掌再度出現，手裡還拿著小次郎先前送給它那袋食物。小次郎將食物喂給刺球仙人掌吃後，刺球仙人掌非常開心，於是加入了火箭隊，成為小次郎的新寶可夢。
主要事件
武藏和小次郎把阿柏怪和雙彈瓦斯放歸野生環境。 小次郎收服了刺球仙人掌。 04 告別風鈴鈴在超世代動畫系列的第146集《魔尼尼登場！休息之館！》中，小次郎的風鈴鈴生病了，小次郎不忍心讓它忍受病痛的折磨踏上旅程，於是將風鈴鈴留在了自家的一座別墅當中。
劇情回顧
我旅途中，小遙的小卡比獸看上去很難受，而且沒有如何食欲，眾人所在地附近也沒有寶可夢中心。就在一籌莫展的時候，一對帶著魔尼尼路過的老兩口向他們伸出了援手，讓眾人把小卡比獸帶到他們家中照顧。
與此同時，小次郎的風鈴鈴也似乎病了，急著尋找寶可夢中心的小次郎看見了不遠處的城堡，似乎他找到了熟人。原來這裡是小次郎家的一座別墅。幫助小智的老兩口是小次郎家的傭人……
主要事件
小遙和小勝知道了小次郎是富家子弟。 小次郎將風鈴鈴留在別墅靜養。 小次郎收服了魔尼尼。 05 告別刺球仙人掌在珍珠鑽石動畫系列的第53集《菜種與刺球仙人掌！告別是為了誰！》中，小智等人和菜種、小次郎做了一場雙人合作賽。為了讓刺球仙人掌變得更強，小次郎決定將其留了下來。
劇情回顧
旅行途中，眾人路過塔吉西鎮，碰巧遇到了百代道館的道館館主菜種。她正在對鎮上的孩子們做寶可夢對戰的普及活動。這時，火箭隊現身了，之後在菜種的提議下，小智等人和菜種、小次郎做了一場雙人合作賽。
菜種對小次郎指出，刺球仙人掌具有變強的素質，但目前它的才能沒有完全發揮出來，於是她提出「何不將它託付於我？」。小次郎便開始與刺球仙人掌進行猛烈的特訓，刺球仙人掌很快地就弄得一身狼狽，然而它仍一心一意地堅持著。但由於特訓總是達不到預期的成果，小次郎信心全失。這時，菜種再次出現在小次郎的面前……
主要事件
小智一行人和火箭隊三人組再次遇到菜種。 小智和小光與小次郎和菜種進行雙人對戰的練習賽，由小智和小光獲勝。 小次郎的刺球仙人掌開始學習吸取拳。 小次郎把自己的刺球仙人掌託付給菜種訓練。 06 告別毒粉蛾在珍珠鑽石動畫系列的第72集《再見了 毒粉蛾！》中，武藏的毒粉蛾發現一隻顏色不同的毒粉蛾並陷入了愛河，便將毒粉蛾放歸森林。
劇情回顧
火箭隊追著小智一行人來到位於湖畔的寶可夢中心。結果，武藏的毒粉蛾發現一隻顏色不同的毒粉蛾，飛到湖上了。此時，自稱大樹的少年出現，對武藏表示「我的毒粉蛾與你的毒粉蛾看來是陷入了愛河的樣子呢！」聽說這個季節，受到映照於湖面的滿月光輝導引，戀愛的毒粉蛾們會聚集到湖上，越過天冠山進行遷徙的樣子。而且，今天正是那個滿月之日！
知道毒粉蛾戀愛了，讓武藏想起年少時期心酸的戀愛回憶。這時候，突來的落雷擊毀湖邊的巖石，使得湖水外流，這樣下去會讓毒粉蛾無法進行遷徙的！在這種狀況下，武藏到底會採取什麼行動！？而毒粉蛾的戀情又會如何發展？
主要事件
武藏將她的毒粉蛾放歸野生環境。 07 告別滾滾蝙蝠、哭哭面具、輕飄飄和敗露球菇在超級願望動畫系列的第142集《我的夢想，寶可夢大師!!》中，火箭隊因為要前往卡洛斯地區，火箭隊三人組將他們的滾滾蝙蝠、哭哭面具、輕飄飄和敗露球菇交給阪木。
劇情回顧
小智環繞傑可羅拉群島的旅行，在到達關都地區的枯葉市後終於告一段落。小智跟艾莉絲和天桐告別，各自向自己的夢想進發。小智和三色堇一起回到真新鎮，在回家不久後立即前往大木博士的研究所，與寶可夢見面。
小智回顧了在合眾地區的冒險，決定前往卡洛斯地區，實現自己成為「寶可夢大師」的夢想。
主要事件
小智和三色堇離開關都地區，前往卡洛斯地區。 小智將除皮卡丘外的所有寶可夢都留在大木研究所。 小建前往華藍道館幫忙。 火箭隊三人組將他們的滾滾蝙蝠、哭哭面具、輕飄飄和敗露球菇交給阪木，隨後果然翁歸隊。 火箭隊三人組得知小智要前往卡洛斯地區，便率先前往卡洛斯地區等待。 08 告別好啦魷（未遂）在XY動畫系列的第54集《烏賊王對好啦魷！用情誼來拯救世界!!》中，小智一行人在旅途中再次遇上曾經佔據電波觀測店的烏賊王！此時小次郎的好啦魷有點異樣……
劇情回顧
小智一行人在旅途中再次遇上曾經佔據電波觀測店的烏賊王！小智幾個和火箭隊被烏賊王操控，動彈不能。
希特隆、小次郎和喵喵幸運逃脫，想找辦法拯救其他人，此時小次郎的好啦魷有點異樣……
主要事件
小智一行人及火箭隊與Ｘ夫人的陰謀！恐怖的烏賊王!!中的君莎再次相遇。 小智一行人及火箭隊還有君莎再次與妄圖改造世界的烏賊王相遇，並挫敗了三隻烏賊王的陰謀。 09 告別果然翁（未遂）在XY動畫系列的第63集《迷路就走上人生的岔路!? 武藏與果然翁!!》中，跟小智對戰後，武藏和果然翁跟小次郎和喵喵失散了。武藏本來與果然翁要退出火箭隊，跟著偉特生活，最後放棄。
劇情回顧
跟小智對戰後，武藏和果然翁跟小次郎和喵喵失散了。他們掉進河裡遇險，被醫生偉特所救。武藏醒後對偉特一見鍾情！
果然翁也跟偉特的拍檔果然翁相處得很好。武藏究竟會選擇愛還是繼續走罪惡的道路呢？
主要事件
武藏本來與果然翁要退出火箭隊，跟著偉特生活，最後放棄。 10 告別南瓜精（未遂）在XY動畫系列的第81集《南瓜怪人變裝慶典！再見了，南瓜精!?》中，小智一行人在途經的鎮參加一個變裝成寶可夢的祭典。咦？南瓜精要結婚？
劇情回顧
小智一行人在途經的鎮參加一個變裝成寶可夢的祭典，南瓜怪人變裝慶典。但是突然間，有個神秘老人帶著幾隻南瓜怪人襲擊他們！
變裝成皮卡丘的哈力栗亦被老人搶走。看來又是火箭隊在背後搞事…咦？南瓜精要結婚？ 主要事件
小智一行人參加了南瓜怪人變裝慶典。 揭露武藏的南瓜精的性別為雌性，體型為特大體型。 武藏的南瓜精與南瓜伯爵的大嘴娃進行交換，並進化為南瓜怪人，之後又換了回來。 11 告別好壞星（未遂）在日月動畫系列的第58集《不要哭，好壞星！》中，火箭隊外出購物時，偶遇了好壞星以前仰慕的前輩！雖然現在的好壞星眼中只有小次郎一人，但即使如此前輩說它還是喜歡好壞星。
劇情回顧
火箭隊外出購物時，偶遇了好壞星以前仰慕的前輩！雖然現在的好壞星眼中只有小次郎一人，但前輩說即使如此它還是喜歡好壞星。
為了贏得好壞星的芳心，小次郎和前輩開始了激烈對戰。這場戀情究竟會如何發展呢!?
主要事件
小次郎嘗試收服雌性輕飄飄，但因好壞星阻止失敗了。 火箭隊三人組與好壞星的前輩兼初戀對象超壞星見面。 小次郎打算放生好壞星，成全它與超壞星，但好壞星選擇繼續和他一起。 12 告別謎擬丘和好壞星在日月動畫系列的第146集《謝謝阿羅拉！各自的啟程!!》中，小智決定回到真新鎮，火箭隊和謎擬Ｑ它們道別的時刻也近了…。
劇情回顧
小智決定回到真新鎮，但卻無法對大家說出口…。
同一時刻，火箭隊和謎擬Ｑ它們道別的時刻也近了…。
主要事件
莉莉艾、格拉吉歐、露莎米奈乘船離開阿羅拉地區去尋找莫恩。 小智的洛托姆圖鑒決定留在乙太樂園工作。 小智和皮卡丘與小星雲重逢，並前往究極之洞的另一端冒險，之後回到阿羅拉。 小智返回真新鎮，並把除了皮卡丘之外的所有同行寶可夢寄放在庫庫伊博士家中。 馬瑪內和馬睿因前往綠嶺宇宙中心。 卡奇跟隨麗姿修行。 水蓮跟隨其父一起去做海洋調查，尋找瑪納霏。 烏魯結束修行回到艾納餐館，並送給瑪奧一束葛拉西蒂亞花，謝米接觸葛拉西蒂亞花後變為天空形態，和同伴一起離開。 武藏和小次郎把謎擬Ｑ和好壞星留在火箭隊阿羅拉支部，然後和喵喵、果然翁返回火箭隊總部。 小次郎將Ｚ強力手環和惡Ｚ留給好壞星保管。 胖丁躲在小智所乘飛機的機艙中，回到關都地區。 片尾畫面顯示哈烏正在挑戰烏拉烏拉島的大考驗。 片尾畫面顯示古茲馬在和骷髏隊進行特訓。 片尾畫面顯示芭內特博士懷有身孕。劇情回顧
前往卡那茲市的小智一行人來到一座森林，聽說最近這一帶目無法紀的寶可夢盜獵者很倡狂。由於發現了盜獵者使用的捕獲網的一部份，小智一行人遂加入幫忙君莎小姐追捕犯人。
火箭隊三人組偶然發現寶可夢獵人阿隆抓到的大量有毒寶可夢阿柏蛇與瓦斯彈，原來他是受雇傭來捕捉毒屬性寶可夢的。由於長期以來的好搭擋阿柏怪與雙彈瓦斯就是由阿柏蛇和瓦斯彈進化而來，對這兩種寶可夢有深厚感情的火箭隊，下定決心要救出這群寶可夢並把它們收為同伴。
但是這個行動被盜獵者阿隆發現，火箭隊的阿柏怪與雙彈瓦斯也成了他想要捕捉的目標！面對使用實力強大的寶可夢大嘴雀、班基拉斯的阿隆，火箭隊完全無反抗能力！但是喵喵頂著強力的高壓電擊拼命放出了所有的瓦斯彈和阿柏蛇，並且由武藏和小次郎拼死拖住阿隆的行動，讓雙彈瓦斯和阿柏怪保護大家迅速逃跑。
阿隆打倒了火箭隊，試圖重新捕捉逃走的阿柏蛇和瓦斯彈，但被趕來的小智一行人和君莎小姐截住，君莎小姐命令阿隆立即釋放盜獵得來的寶可夢，阿隆惱怒地說那些寶可夢早已被其他人救走了，小智感慨這個世界還是好人更多。
告別了阿柏怪和雙彈瓦斯的火箭隊三人組走在森林中，仍念念不忘它們能否保護好自己的同伴。這時之前在他們被一群大針蜂圍攻時伸出援手的那只刺球仙人掌再度出現，手裡還拿著小次郎先前送給它那袋食物。小次郎將食物喂給刺球仙人掌吃後，刺球仙人掌非常開心，於是加入了火箭隊，成為小次郎的新寶可夢。
主要事件
武藏和小次郎把阿柏怪和雙彈瓦斯放歸野生環境。 小次郎收服了刺球仙人掌。 04 告別風鈴鈴在超世代動畫系列的第146集《魔尼尼登場！休息之館！》中，小次郎的風鈴鈴生病了，小次郎不忍心讓它忍受病痛的折磨踏上旅程，於是將風鈴鈴留在了自家的一座別墅當中。
劇情回顧
我旅途中，小遙的小卡比獸看上去很難受，而且沒有如何食欲，眾人所在地附近也沒有寶可夢中心。就在一籌莫展的時候，一對帶著魔尼尼路過的老兩口向他們伸出了援手，讓眾人把小卡比獸帶到他們家中照顧。
與此同時，小次郎的風鈴鈴也似乎病了，急著尋找寶可夢中心的小次郎看見了不遠處的城堡，似乎他找到了熟人。原來這裡是小次郎家的一座別墅。幫助小智的老兩口是小次郎家的傭人……
主要事件
小遙和小勝知道了小次郎是富家子弟。 小次郎將風鈴鈴留在別墅靜養。 小次郎收服了魔尼尼。 05 告別刺球仙人掌在珍珠鑽石動畫系列的第53集《菜種與刺球仙人掌！告別是為了誰！》中，小智等人和菜種、小次郎做了一場雙人合作賽。為了讓刺球仙人掌變得更強，小次郎決定將其留了下來。
劇情回顧
旅行途中，眾人路過塔吉西鎮，碰巧遇到了百代道館的道館館主菜種。她正在對鎮上的孩子們做寶可夢對戰的普及活動。這時，火箭隊現身了，之後在菜種的提議下，小智等人和菜種、小次郎做了一場雙人合作賽。
菜種對小次郎指出，刺球仙人掌具有變強的素質，但目前它的才能沒有完全發揮出來，於是她提出「何不將它託付於我？」。小次郎便開始與刺球仙人掌進行猛烈的特訓，刺球仙人掌很快地就弄得一身狼狽，然而它仍一心一意地堅持著。但由於特訓總是達不到預期的成果，小次郎信心全失。這時，菜種再次出現在小次郎的面前……
主要事件
小智一行人和火箭隊三人組再次遇到菜種。 小智和小光與小次郎和菜種進行雙人對戰的練習賽，由小智和小光獲勝。 小次郎的刺球仙人掌開始學習吸取拳。 小次郎把自己的刺球仙人掌託付給菜種訓練。 06 告別毒粉蛾在珍珠鑽石動畫系列的第72集《再見了 毒粉蛾！》中，武藏的毒粉蛾發現一隻顏色不同的毒粉蛾並陷入了愛河，便將毒粉蛾放歸森林。
劇情回顧
火箭隊追著小智一行人來到位於湖畔的寶可夢中心。結果，武藏的毒粉蛾發現一隻顏色不同的毒粉蛾，飛到湖上了。此時，自稱大樹的少年出現，對武藏表示「我的毒粉蛾與你的毒粉蛾看來是陷入了愛河的樣子呢！」聽說這個季節，受到映照於湖面的滿月光輝導引，戀愛的毒粉蛾們會聚集到湖上，越過天冠山進行遷徙的樣子。而且，今天正是那個滿月之日！
知道毒粉蛾戀愛了，讓武藏想起年少時期心酸的戀愛回憶。這時候，突來的落雷擊毀湖邊的巖石，使得湖水外流，這樣下去會讓毒粉蛾無法進行遷徙的！在這種狀況下，武藏到底會採取什麼行動！？而毒粉蛾的戀情又會如何發展？
主要事件
武藏將她的毒粉蛾放歸野生環境。 07 告別滾滾蝙蝠、哭哭面具、輕飄飄和敗露球菇在超級願望動畫系列的第142集《我的夢想，寶可夢大師!!》中，火箭隊因為要前往卡洛斯地區，火箭隊三人組將他們的滾滾蝙蝠、哭哭面具、輕飄飄和敗露球菇交給阪木。
劇情回顧
小智環繞傑可羅拉群島的旅行，在到達關都地區的枯葉市後終於告一段落。小智跟艾莉絲和天桐告別，各自向自己的夢想進發。小智和三色堇一起回到真新鎮，在回家不久後立即前往大木博士的研究所，與寶可夢見面。
小智回顧了在合眾地區的冒險，決定前往卡洛斯地區，實現自己成為「寶可夢大師」的夢想。
主要事件
小智和三色堇離開關都地區，前往卡洛斯地區。 小智將除皮卡丘外的所有寶可夢都留在大木研究所。 小建前往華藍道館幫忙。 火箭隊三人組將他們的滾滾蝙蝠、哭哭面具、輕飄飄和敗露球菇交給阪木，隨後果然翁歸隊。 火箭隊三人組得知小智要前往卡洛斯地區，便率先前往卡洛斯地區等待。 08 告別好啦魷（未遂）在XY動畫系列的第54集《烏賊王對好啦魷！用情誼來拯救世界!!》中，小智一行人在旅途中再次遇上曾經佔據電波觀測店的烏賊王！此時小次郎的好啦魷有點異樣……
劇情回顧
小智一行人在旅途中再次遇上曾經佔據電波觀測店的烏賊王！小智幾個和火箭隊被烏賊王操控，動彈不能。
希特隆、小次郎和喵喵幸運逃脫，想找辦法拯救其他人，此時小次郎的好啦魷有點異樣……
主要事件
小智一行人及火箭隊與Ｘ夫人的陰謀！恐怖的烏賊王!!中的君莎再次相遇。 小智一行人及火箭隊還有君莎再次與妄圖改造世界的烏賊王相遇，並挫敗了三隻烏賊王的陰謀。 09 告別果然翁（未遂）在XY動畫系列的第63集《迷路就走上人生的岔路!? 武藏與果然翁!!》中，跟小智對戰後，武藏和果然翁跟小次郎和喵喵失散了。武藏本來與果然翁要退出火箭隊，跟著偉特生活，最後放棄。
劇情回顧
跟小智對戰後，武藏和果然翁跟小次郎和喵喵失散了。他們掉進河裡遇險，被醫生偉特所救。武藏醒後對偉特一見鍾情！
果然翁也跟偉特的拍檔果然翁相處得很好。武藏究竟會選擇愛還是繼續走罪惡的道路呢？
主要事件
武藏本來與果然翁要退出火箭隊，跟著偉特生活，最後放棄。 10 告別南瓜精（未遂）在XY動畫系列的第81集《南瓜怪人變裝慶典！再見了，南瓜精!?》中，小智一行人在途經的鎮參加一個變裝成寶可夢的祭典。咦？南瓜精要結婚？
劇情回顧
小智一行人在途經的鎮參加一個變裝成寶可夢的祭典，南瓜怪人變裝慶典。但是突然間，有個神秘老人帶著幾隻南瓜怪人襲擊他們！
變裝成皮卡丘的哈力栗亦被老人搶走。看來又是火箭隊在背後搞事…咦？南瓜精要結婚？ 主要事件
小智一行人參加了南瓜怪人變裝慶典。 揭露武藏的南瓜精的性別為雌性，體型為特大體型。 武藏的南瓜精與南瓜伯爵的大嘴娃進行交換，並進化為南瓜怪人，之後又換了回來。 11 告別好壞星（未遂）在日月動畫系列的第58集《不要哭，好壞星！》中，火箭隊外出購物時，偶遇了好壞星以前仰慕的前輩！雖然現在的好壞星眼中只有小次郎一人，但即使如此前輩說它還是喜歡好壞星。
劇情回顧
火箭隊外出購物時，偶遇了好壞星以前仰慕的前輩！雖然現在的好壞星眼中只有小次郎一人，但前輩說即使如此它還是喜歡好壞星。
為了贏得好壞星的芳心，小次郎和前輩開始了激烈對戰。這場戀情究竟會如何發展呢!?
主要事件
小次郎嘗試收服雌性輕飄飄，但因好壞星阻止失敗了。 火箭隊三人組與好壞星的前輩兼初戀對象超壞星見面。 小次郎打算放生好壞星，成全它與超壞星，但好壞星選擇繼續和他一起。 12 告別謎擬丘和好壞星在日月動畫系列的第146集《謝謝阿羅拉！各自的啟程!!》中，小智決定回到真新鎮，火箭隊和謎擬Ｑ它們道別的時刻也近了…。
劇情回顧
小智決定回到真新鎮，但卻無法對大家說出口…。
同一時刻，火箭隊和謎擬Ｑ它們道別的時刻也近了…。
主要事件
莉莉艾、格拉吉歐、露莎米奈乘船離開阿羅拉地區去尋找莫恩。 小智的洛托姆圖鑒決定留在乙太樂園工作。 小智和皮卡丘與小星雲重逢，並前往究極之洞的另一端冒險，之後回到阿羅拉。 小智返回真新鎮，並把除了皮卡丘之外的所有同行寶可夢寄放在庫庫伊博士家中。 馬瑪內和馬睿因前往綠嶺宇宙中心。 卡奇跟隨麗姿修行。 水蓮跟隨其父一起去做海洋調查，尋找瑪納霏。 烏魯結束修行回到艾納餐館，並送給瑪奧一束葛拉西蒂亞花，謝米接觸葛拉西蒂亞花後變為天空形態，和同伴一起離開。 武藏和小次郎把謎擬Ｑ和好壞星留在火箭隊阿羅拉支部，然後和喵喵、果然翁返回火箭隊總部。 小次郎將Ｚ強力手環和惡Ｚ留給好壞星保管。 胖丁躲在小智所乘飛機的機艙中，回到關都地區。 片尾畫面顯示哈烏正在挑戰烏拉烏拉島的大考驗。 片尾畫面顯示古茲馬在和骷髏隊進行特訓。 片尾畫面顯示芭內特博士懷有身孕。