1959年1月6日， 兩架圖-16飛機由蘇聯飛抵哈爾濱飛機廠（122廠）， 哈爾濱飛機廠開始了仿製工作。
這一年5月， 作為設計技術骨幹的馬鳳山被派往蘇聯喀山圖-16飛機生產工廠實習靜力試驗， 重點考察蘇聯飛機強度規範， 以及圖-16飛機強度計算及靜力試驗情況， 掌握了不少技術資料。
在蘇聯喀山學習期間
特別是蘇聯專家在作講座報告時一再強調說， 這些資料會全部發往中國， 你們不用記筆記。 但馬鳳山不但用心聽講， 而且還認真記下了極為詳盡的筆記。 而這就是後來為轟-6的仿製、改進設計工作提供了重要依據、起到了重大作用，
而我方人員回國後， 蘇聯在課堂上“答應”給的資料卻遲遲不見到來。 蘇聯方面的答覆， 這些資料是蘇聯中央流體動力研究院編寫的， 不是工廠生產資料， 不屬於圖-16飛機合同中該提供的資料。
馬鳳山回國任轟-6甲仿製主管設計師， 從一級技術員破格晉升為副工程師。 轟-6的仿製工作從哈爾濱飛機場轉移到了西安飛機廠（陝西機械廠）， 在工作中“馬鳳山筆記”派上了極大的用場。 馬鳳山的這本用蘇聯出產的一種很厚的軟皮學生練習本做的筆記， 包含大量圖-16飛機的總體、強度、試飛等各類關鍵資訊， 具有很大的權威性。 這本“馬鳳山筆記”是廠裡的絕密級檔， 一開始設計人員要“一睹尊容”要經過政審，
轟-6甲的部分氣動參數取自“馬鳳山筆記”；“馬鳳山筆記”為我國轟-6飛機進行強度計算， 確定原始資料及編制靜力試驗任務書提供了依據， 以及說在我國大型噴氣客機的起步研製中都起到了參考作用。 70年代， 確定轟-6甲飛機的機體首翻期時， 還採用了“馬鳳山筆記”中的資料作為參考依據。
1964年， 馬鳳山調到西安飛機廠任設計科副科長、設計所副所長， 還擔任了運-8飛機設計的技術總負責人， 組織領導飛機的測繪設計工作， 制訂了測繪設計總方案， 確定了重大更改專案， 為運8飛機後來的測繪試製打下了基礎。
馬鳳山， 我國自行設計的大型客機一一運10的總設計師
1970年8月， 國家向上海市下達了研製大型客機一一運10飛機的任務。 馬鳳山奉調至上海708設計組（也就是後來的“上海飛機研究所”）參加運10飛機的設計工作， 擔任技術總負責人， 並於1979年10月被任命為運10總設計師， 1982年7月任上海飛機研究所所長。