太魯閣號事件後， 臺鐵公司化的問題， 再度引發討論， 而臺鐵內部傳出， 去年9月就提出組改計畫， 並規劃了4大方向， 包含從營運和資產債務等， 研議公司化改革， 同時打算設立分公司， 負責不動產開放和商場業務， 但臺鐵工會也擔憂， 一旦轉為公司化， 權益會受到影響， 不過臺鐵規劃， 員工還是可以保療公務員資格， 或清算年資進入公司體制。
交大運輸物流管理學系教授黃臺生：「幾個車站都蓋的很漂亮， 那都是用納稅人的錢， 如果說公司些東西， 到底是算誰的。 」
百年老店臺鐵連年虧損， 還包括要承擔， 龐大退撫金支出和營運保養， 專家點出臺鐵公司化， 後可能出現的阻力， 事實上臺鐵要不要公司化討論多年， 傳出內部早有計畫， 朝四大面向進行。
若改組為臺鐵股份有限公司， 由政府百分百持股， 鐵路建設營運維修， 公司化後變成鐵道局出錢建設， 臺鐵改用租用， 若沒有賺錢能比照北捷， 1元向政府承租。
另外旗下還要組成， 臺鐵資產開發分公司， 負責不動產開發都更， 至於周邊商品規劃設立， 鐵路副業營運分公司， 車勤文創觀光附屬產業， 增加收入。
交大運輸物流管理學系教授黃臺生：「臺鐵不是不行， 而是有很多制度的僵化， 所以我覺得如果公司化以後， 對他的周邊商品， 周邊的企業經營， 應該能更放手去做。 」
活化地產蓋商場調整票價， 轉虧為盈， 高鐵和日本國鐵都是很好借鏡， 除此之外公司化下，
臺鐵產業工會理事長王傑：「大家是辛苦國家考試進來的， 結果你一句公司化之後， 結清所有大家的年資， 那身分待遇， 是不是就沒有任何的保障。 」
工會擔憂改成公司模式經營， 原本該有的權益受到影響， 更有財團化風險， 反而拖延臺鐵對人力， 和安全的改革， 去年9月就有提出組改計畫， 原定4月中要和交通部長簡報， 沒想到卻發生太魯閣號事件， 讓公司化構想再度浮上檯面。