自來也一輩子遊歷四方， 尋找預言之子， 然而一無所獲。 終於， 他回到木葉村， 遇到了鳴人——這個以自己書籍主人公為名的少年。 自來也與鳴人開始修行， 教會了他螺旋丸， 並找到了綱手， 但是卻遇到了大蛇丸。 原來大蛇丸的雙手被三代火影的屍鬼封盡封印， 想找綱手治療， 並以復活綱手的戀人和弟弟為誘餌， 綱手不希望波及自來也， 於是對他下了藥， 獨自去見大蛇丸， 自來也醒來後， 立刻去支援綱手， 但因為藥效未過只能動用不到三成的實力。
綱手對自來也下藥
於是這次三忍對決變得有些喜感，
最後大蛇丸敗走， 綱手還是主力， 自來也全程劃水， 不過這三個人的通靈獸比較有意思， 妙木山的蛤蟆、濕骨林的蛞蝓、龍地洞的蛇都是仙地生物， 自來也是誤入妙木山才得以與蛤蟆簽訂契約， 綱手和大蛇丸是怎麼和這些召喚獸簽約的呢？
萬蛇、蛤蟆文太、蛞蝓
之後自來也指導鳴人修行長達三年， 這期間， 自來也一直試圖讓鳴人徹底掌控九尾的力量， 他用四代封印的鑰匙略微打開了九尾的封印， 結果鳴人瞬間被九尾的力量吞噬， 進入了四尾的狀態，
有人就會說了自來也怎麼打個四尾狀態的鳴人就受傷啦， 大蛇丸不用手跟四尾鳴人打都全身而退， 佩恩連八尾鳴人都能打。
但要知道能打和控制完全是兩種層次， 自來也不會木遁， 要近身貼符， 同時還要顧忌不能傷到鳴人， 而大蛇丸只需要躲技能邊緣OB即可， 打不過轉身就能走， 佩恩嘛…人家直接打九尾也不在話下。
佩恩擋八尾鳴人的尾獸炮
三年後， 兩人結束修行回到了木葉， 但自來也並沒有安頓下來， 而是立刻離開村子調查曉組織， 終於， 他查到了曉組織首領的藏身處， 在雨隱村， 也就是當年遇到長門等人的村子。
不過由於這個村子常年封閉， 具體的情況未知， 為了確認情報的真偽，
綱手非常擔心自來也的安危， 為了讓她安心， 自來也提議讓逢賭必輸的綱手賭自己會死， “不過等到我回來贏得賭約的時候”， 你嫁給我可好……
自來也與綱手的最後一面
後半句是我加的， 這句話自來也最終還是欲言又止， 而綱手看起來正在等他說出口。 自來也告別了綱手， 告別了木葉， 隻身前往雨隱村。
利用時空忍術潛入雨隱村後， 自來也發現這個村子比他想像中的更為安定、繁榮， 通過走訪得知， 山椒魚半藏已經不是這個村子的首領， 這個村子現在的首領叫做佩恩， 而且這個村子的人都對佩恩非常敬仰。
自來也得知， 佩恩憑藉一己之力殺死了半藏，
原來早在自來也踏入雨隱村的那一刻， 佩恩就已經掌握的他的行蹤， 雨隱村常年不斷的雨， 正是佩恩的感知忍術， 不過小南並不是自來也的對手， 而且紙片忍術被火和油克制， 小南的紙片浸油後無法使用， 被自來也輕易擒獲， 不過佩恩很快出手， 第一個出現的是精通通靈術的畜生道。
畜生道的通靈獸
當自來也看到他的輪回眼時， 以為他是樣貌大變的長門， 自來也質問他為什麼要收集尾獸？長門告訴了自來也， 他是為了永久的和平， 收集尾獸是為了開發出可以瞬間毀滅一個國家的禁術兵器，
其實就跟現在的核威懾是一模一樣的， 不過有一點做得更好， 就是長門打算給所有國家都提供核武器， 不會出現無核國家被肆意侵略的情況。
但是， 長門的這個計畫肯定是行不通的， 因為他被帶土和斑利用了， 斑又被黑絕利用， 最後的結果只會是無限月讀， 人類瀕臨滅絕， 而且自來也追求的和平並不是武力威懾， 他決定在此阻止長門。
仙人模式發動！！
知道對手的強大， 自來也立刻準備進入仙人模式， 但吸收自然力量需要時間， 他通靈出蛤蟆健與對方周旋， 但對方的通靈獸層出不窮， 有一種可以無限分裂的狗尤為棘手， 自來也用影分身把這些狗引到一起，召喚出大蛤蟆的食道將他們一舉吞噬，之後又出現一隻怪鳥，自來也用火遁將其解決，緊接著又出現一隻犀牛，被自來也的分身幹掉。
畜生道的通靈獸一隻接著一隻，但此時自來也已經準備完畢，召喚出深作、志麻兩位蛤蟆仙人，進入了仙人模式，力量、速度以及忍術威力巨幅提升，攻擊方式也發生了變化，這些通靈獸不是他的一合之敵。
三位仙人聯手使出仙法·五右衛門
這時畜生道通靈出餓鬼道和人間道助陣，人間道被自來也一腳踢飛，但能夠吸收忍術的餓鬼道卻非常棘手，自來也和兩位蛤蟆仙人聯手使用仙法·五右衛門被完全吸收，喂喂...不是仙術不能被吸收嗎，難道那是後加的設定？之後的超大玉螺旋丸也被吸收，連攻向對方死角的體術都被擋下。
自來也猜測對方擁有同樣的眼睛，很可能共用視覺，既然忍術和體術無效，那麼就只能用幻術了，雖然自來也完全不會用幻術，但兩位蛤蟆仙人卻可以聯手施展強大的幻術蛤蟆臨唱，而且這種幻術通過聲音傳播，輪回眼也無法抵擋。
蛤蟆臨唱一舉束縛了三個敵人，自來也將他們一一殺死，他以為已經解決了全部敵人，放鬆了警惕，突然又一個佩恩悄無聲息從他身後偷襲，自來也措手不及，斷了一條手臂。
修羅道突然背後偷襲
此時佩恩六道悉數登場，之前解決的三道也被復活，而自來也失去了左手無法結印，戰鬥力大損，單手與佩恩六道作戰，他依然把畜生道拖入時空結界，用螺旋丸將其幹掉。
這時他才發現，這個人是他以前遊歷世界時遇到過的忍者，兩隻蛤蟆勸他就此撤退，從長計議，但自來也必須出去確認一件事，如果現在撤退，以後再想接近佩恩就很難了，他再次回到雨隱村，終於確認了佩恩六道的真面目。
這些人竟然全都是他遊歷世界時遇到的各色忍者，也就是說佩恩六道其實是被操控的傀儡，真正的佩恩只有一人。然而震驚中，自來也被水底的佩恩偷襲，六道同時出手，將自來也直接擊敗。
自來也被佩恩六道打敗
自來也終於明白，預言之子並不是長門，而是鳴人，自來也用最後的力量把佩恩的情報寫在蛤蟆的背上，在佩恩的攻擊中沉入水底，但他露出了如釋重負的笑容。
他一直以為自己對“預言之子”的引導失敗了，當年沒有培養好長門，直到最後也沒能阻止佩恩。
但事實上，他把鳴人的父親培養成了偉大的忍者，所寫的書賜予了鳴人名字，同時對鳴人的悉心教導幫助他成長，給了他家人般的溫暖，直到最後自來也才意識到，他已經在無意間正確的引導了“預言之子”。
真正的預言之子是鳴人
自來也與佩恩的這一戰，前半段是佔據優勢的，擊殺佩恩三道時毫髮無損，而且看起來查克拉非常充足。從被修羅道背後偷襲，失去手臂開始，戰況急轉而下。
通過自來也的幾次戰鬥可以發現，他的戰鬥方式非常正派、傳統，依靠結印使用忍術、卷軸使用封印術，不像一些依靠瞳術的忍者只需要瞪眼就能戰鬥，因此失去一條手臂無法結印的影響非常大，以至於後來只能用單手施展螺旋丸戰鬥。
如果自來也一開始就知道敵人有六個，沒有掉以輕心，恐怕結果會有改變，佩恩後來自己也說不靠這個秘密無法戰勝自來也。
幹掉佩恩三道時毫髮無損
但雖然結果會有改變，自來也可能查清佩恩的真面目後用時空忍術全身而退，卻並不意味著自來也能夠打敗佩恩，事實上最強的天道並沒怎麼出手。
後來仙人模式的鳴人實力已經超越了自來也，但對戰佩恩天道時，如果不是雛田擋刀也是要被直接擊殺的，更何況自來也對佩恩的情報一無所知，在完全不知道對方戰鬥方式的情況下隻身對敵，而鳴人那時候已經知道了佩恩的大部分情報，並且是以全村之力對敵。
天道的神羅天征
對於自來也的實力如果要做一個比較客觀的評價，那應該是截止他死的時候，以當時的戰鬥力設定，他的實力幾乎一人之下，在他死後，大筒木的神仙後代們登場，戰鬥力跨次元的飆升，自來也就不行了，只能算一個比較厲害的影級強者。
這恐怕也是岸本急於讓他謝幕的原因。如果讓自來也參與到後期的戰鬥中，以他前期木葉最強者的定位，難免開出雙萬花筒卡凱西、八門凱那樣的外掛，這對於自來也這種深沉的完美人設來說，顯得有些輕浮。
自來也的光輝人生
自來也的故事到此結束，之後穢土轉生的集體復活也沒有讓他再次出場，我覺得這是很好的安排，一方面，自來也已經完成了自己的使命，很好的推動了火影的劇情，唯一的遺憾就是與綱手的情感沒有挑明，不過這樣的一層窗戶紙也有朦朧的美感。
另一方面，根據無屍必活的定律，以及最後沉入水底時自來也意識尚存，因此他的死亡其實是開放性的，後來兜說找不到自來也的屍體，但事實上雨隱村的水池就那麼點大，炸成灰的迪達拉都能找到，怎麼可能找不到自來也？
加上最近《博人傳》中自來也復活的謠言四起，恐怕一旦有需要，製作組就會讓他再次登場，只希望博人傳不要畫崩。
自來也用影分身把這些狗引到一起，召喚出大蛤蟆的食道將他們一舉吞噬，之後又出現一隻怪鳥，自來也用火遁將其解決，緊接著又出現一隻犀牛，被自來也的分身幹掉。畜生道的通靈獸一隻接著一隻，但此時自來也已經準備完畢，召喚出深作、志麻兩位蛤蟆仙人，進入了仙人模式，力量、速度以及忍術威力巨幅提升，攻擊方式也發生了變化，這些通靈獸不是他的一合之敵。
三位仙人聯手使出仙法·五右衛門
這時畜生道通靈出餓鬼道和人間道助陣，人間道被自來也一腳踢飛，但能夠吸收忍術的餓鬼道卻非常棘手，自來也和兩位蛤蟆仙人聯手使用仙法·五右衛門被完全吸收，喂喂...不是仙術不能被吸收嗎，難道那是後加的設定？之後的超大玉螺旋丸也被吸收，連攻向對方死角的體術都被擋下。
自來也猜測對方擁有同樣的眼睛，很可能共用視覺，既然忍術和體術無效，那麼就只能用幻術了，雖然自來也完全不會用幻術，但兩位蛤蟆仙人卻可以聯手施展強大的幻術蛤蟆臨唱，而且這種幻術通過聲音傳播，輪回眼也無法抵擋。
蛤蟆臨唱一舉束縛了三個敵人，自來也將他們一一殺死，他以為已經解決了全部敵人，放鬆了警惕，突然又一個佩恩悄無聲息從他身後偷襲，自來也措手不及，斷了一條手臂。
修羅道突然背後偷襲
此時佩恩六道悉數登場，之前解決的三道也被復活，而自來也失去了左手無法結印，戰鬥力大損，單手與佩恩六道作戰，他依然把畜生道拖入時空結界，用螺旋丸將其幹掉。
這時他才發現，這個人是他以前遊歷世界時遇到過的忍者，兩隻蛤蟆勸他就此撤退，從長計議，但自來也必須出去確認一件事，如果現在撤退，以後再想接近佩恩就很難了，他再次回到雨隱村，終於確認了佩恩六道的真面目。
這些人竟然全都是他遊歷世界時遇到的各色忍者，也就是說佩恩六道其實是被操控的傀儡，真正的佩恩只有一人。然而震驚中，自來也被水底的佩恩偷襲，六道同時出手，將自來也直接擊敗。
自來也被佩恩六道打敗
自來也終於明白，預言之子並不是長門，而是鳴人，自來也用最後的力量把佩恩的情報寫在蛤蟆的背上，在佩恩的攻擊中沉入水底，但他露出了如釋重負的笑容。
他一直以為自己對“預言之子”的引導失敗了，當年沒有培養好長門，直到最後也沒能阻止佩恩。
但事實上，他把鳴人的父親培養成了偉大的忍者，所寫的書賜予了鳴人名字，同時對鳴人的悉心教導幫助他成長，給了他家人般的溫暖，直到最後自來也才意識到，他已經在無意間正確的引導了“預言之子”。
真正的預言之子是鳴人
自來也與佩恩的這一戰，前半段是佔據優勢的，擊殺佩恩三道時毫髮無損，而且看起來查克拉非常充足。從被修羅道背後偷襲，失去手臂開始，戰況急轉而下。
通過自來也的幾次戰鬥可以發現，他的戰鬥方式非常正派、傳統，依靠結印使用忍術、卷軸使用封印術，不像一些依靠瞳術的忍者只需要瞪眼就能戰鬥，因此失去一條手臂無法結印的影響非常大，以至於後來只能用單手施展螺旋丸戰鬥。
如果自來也一開始就知道敵人有六個，沒有掉以輕心，恐怕結果會有改變，佩恩後來自己也說不靠這個秘密無法戰勝自來也。
幹掉佩恩三道時毫髮無損
但雖然結果會有改變，自來也可能查清佩恩的真面目後用時空忍術全身而退，卻並不意味著自來也能夠打敗佩恩，事實上最強的天道並沒怎麼出手。
後來仙人模式的鳴人實力已經超越了自來也，但對戰佩恩天道時，如果不是雛田擋刀也是要被直接擊殺的，更何況自來也對佩恩的情報一無所知，在完全不知道對方戰鬥方式的情況下隻身對敵，而鳴人那時候已經知道了佩恩的大部分情報，並且是以全村之力對敵。
天道的神羅天征
對於自來也的實力如果要做一個比較客觀的評價，那應該是截止他死的時候，以當時的戰鬥力設定，他的實力幾乎一人之下，在他死後，大筒木的神仙後代們登場，戰鬥力跨次元的飆升，自來也就不行了，只能算一個比較厲害的影級強者。
這恐怕也是岸本急於讓他謝幕的原因。如果讓自來也參與到後期的戰鬥中，以他前期木葉最強者的定位，難免開出雙萬花筒卡凱西、八門凱那樣的外掛，這對於自來也這種深沉的完美人設來說，顯得有些輕浮。
自來也的光輝人生
自來也的故事到此結束，之後穢土轉生的集體復活也沒有讓他再次出場，我覺得這是很好的安排，一方面，自來也已經完成了自己的使命，很好的推動了火影的劇情，唯一的遺憾就是與綱手的情感沒有挑明，不過這樣的一層窗戶紙也有朦朧的美感。
另一方面，根據無屍必活的定律，以及最後沉入水底時自來也意識尚存，因此他的死亡其實是開放性的，後來兜說找不到自來也的屍體，但事實上雨隱村的水池就那麼點大，炸成灰的迪達拉都能找到，怎麼可能找不到自來也？
加上最近《博人傳》中自來也復活的謠言四起，恐怕一旦有需要，製作組就會讓他再次登場，只希望博人傳不要畫崩。