數碼寶貝世界中， 世界樹是很重要的一個設定， 其中有好幾隻數碼獸可以欺負世界樹。 作為數碼寶貝世界的王者， 世界樹也是很無奈！
阿爾法獸
阿爾法獸是皇家騎士團中最強的存在， 本身實力強勁， 世界樹看到他都要跑， 一旦世界樹惹阿爾法獸不開心， 就準備等著被毀滅。
勝利暴龍獸
勝利暴龍獸跟戰鬥暴龍獸有一定的聯繫， 在劇場版中打敗過世界樹。 勝利暴龍獸實力比戰鬥暴龍獸強太多， 是數碼世界的調停者。
大門大獸
大門大獸那一拳一個究極吸血魔獸的畫面， 相信數碼寶貝迷都不會忘記，
奧米加獸X抗體
得到阿爾法獸力量的奧米加獸也是連世界樹都要禮讓的存在， 世界樹跟其打過， 最終也是敗了。 世界樹也真的很無奈， 經常被打敗！