據《日本經濟新聞》6月4日報導， 當日下午， 日本財務省公佈“森友學園”事件調查結果， 財務相麻生太郎“引咎”主動退還12個月的薪資。 此外， 事件處理還決定， 時任理財局長、前國稅廳長官佐川宣壽和理財局總務課長中村稔將被停職， 時任財務省事務次官的佐藤慎一也將受到處分， 其他人也各有不同程度的懲戒， 總計約20人受到懲戒。
報導稱， 日本財務省調查後認為， “佐川宣壽事實上指示部下篡改檔”。 理財局多名職員承認， “受到佐川的指示”， 參與了篡改檔。
不過， 這次調查結果卻認為， 首相官邸和麻生太郎“並未參與其中”。
目前， 日本在野黨仍要求追究麻生責任， 這一調查結果是否能平息事態尚難說。