火影忍者作為長篇漫畫設定上有小漏洞是難免的， 也可以理解。
火影對於人物的刻畫規模比較龐大， 裡面有眾多的設定和情節。 雖然疾風傳總的來說， 主線就是第四次忍界大戰的起因， 經過和結果。 不過就這麼一件事情， 就牽扯了非常複雜的一些關聯。 可能是由於連載的時間過長， 再加上人物眾多， 情節多變。 所以作者在設定上面有一些前後矛盾， 甚至還有一些讓大家覺得不容易接受的設定。
但裡面很多設定都消失不見， 這些你知道嗎？
第一部三代火影才是“忍者之神”， 而初代火影當時， 還是個不知被什麼人宰了的弟弟。
前期火影打鬥場面主要是先試探對手， 收集情報， 找出弱點， 再擬定方案， 擊潰對手。 主要用到的就是戰鬥智商。
白眼不亞於寫輪眼的出身， 中忍考試介紹日向家時的旁白說“追溯寫輪眼的起源就不得不提白眼”， 結果白眼被淪為了背景板， 血輪眼倒是可以進化成萬花筒， 甚至是輪回眼。 傳說中的三大瞳術之一的白眼唯一作用就是透視了。
結印， 當初卡凱西的萬年手速被眾多的人所羨慕， 並且結印在當初設定上真是非常大的亮點。 但也到後來的逐漸簡化， 甚至到沒有。 這個設定， 再不斬， 鬼鮫， 三代， 當初老老實實結印的人都沒有好下場。 。
禁術-多重影分身， 當初設定非常強， 還被騙去偷卷軸， 後期結果是個忍者就會分身， 反而比鳴人的影分身更加有特色。