現代航空母艦的主艦體指的是航空母艦飛行甲板以下的艦體部分。 在縱向看， 航母主艦體按照垂直方向可分為若干層空間。
以美國「小鷹」級航空母艦為例， 從艦底龍骨到飛行甲板共有10層：從下往上第1層為燃油艙和淡水艙；第2至4層為主機艙、鍋爐艙、副機艙以及艦載機的彈藥艙；第5層主要為士兵住艙、食品艙和行政人員辦公室；第6層為各種食堂、住艙；第7層為飛機修理庫；第8-10層大部分為機庫， 還有值班室和飛行員食堂等。
下面著重介紹以下三個結構。
首先是機庫。 一般來說， 航空母艦的甲板或平臺之間（即每一層）的高度為2.4到2.8m， 主艦體中最大的就是機庫， 這也是航母最高大的艙室。 艦載機不同， 機庫的高度略有不同。 有的機庫要占去2至3層甲板的空間。
其次是武器庫。 顧名思義， 這是航母存放武器的地方。 儲備有各式炸彈、魚雷、飛彈和火箭等等， 一般位於水線以下。
最後是升降機。 飛機要從機庫移動到飛機甲板需要借助升降機。 早期的航母升降機一般佈置在飛行甲板的中線上， 稱為「舷內升降機」。 這種升降機的好處是受風浪影響較小， 但缺點也是顯而易見的， 它既影響了飛行甲板的強度， 又影響了飛機的起降。 因此， 後來的設計中， 一般把升降機放在舷側， 這樣的設計也被普遍應用到現代航母上。
從橫向來看， 在主艦體的每一層， 均利用水密隔壁將船分隔為若干水密艙段。 水密隔壁可以防止艙室浸水蔓延到其他艙室， 以保證航空母艦的安全。 現代航空母艦通常以機庫甲板作為水密艙壁甲板， 水密艙壁甲板以下艦體都必須以水密隔壁的形式形成艙室。
總的來說， 航母主艦體是航母的主體部分， 其結構複雜、功能豐富， 體現了航母的技術性。 隨著科技發展， 航母的技術門檻越來越高，