火影忍者裡面的劇情還是比較精彩的， 每一段時期都有強大的BOSS出現， 在火影忍者前期中曉組織還沒出現之前的BOSS是木葉村的叛忍大蛇丸， 作為傳說中的「三忍」， 大蛇丸的實力非常強， 獨身攻陷一個小國都不是什麼問題。 在這種實力的前提下， 大蛇丸還不滿足， 仍然追求強大的力量， 特別是對瞳術非常感興趣， 在大蛇丸叛逃木葉村後不久， 收到了曉組織的加入邀請。
可能動漫裡並沒有相應的劇情， 其實這在火影的遊戲中有過補充， 有一次大蛇丸遇到了佩恩， 見多識廣的大蛇丸知道佩恩的眼睛是輪回眼。
覬覦輪回眼力量的大蛇丸二話不說就對佩恩展開了攻勢， 還說輪回眼是我的了， 但佩恩的實力我們也有目共睹的， 大蛇丸肯定是不敵佩恩的， 佩恩只一個神羅天征就把大師彈飛出去好遠， 大蛇丸就這樣被威懾住了， 後來還加入了曉組織。
宇智波鼬是宇智波一族的天才， 並且在很小的時候就展現出了極高的天賦， 有一次鼬肚子一人在做特殊的危險訓練的時候， 大蛇丸本來還想提醒一下鼬， 誰知道鼬憑藉著寫輪眼完美的完成了訓練， 從此之後大蛇丸就盯上了鼬的寫輪眼。
有一次大蛇丸和鼬獨處的時候， 大蛇丸就偷襲了鼬， 並說道：「寫輪眼， 我就收下了「， 然而大蛇丸被狠狠教育了一次， 鼬一個幻術就秒了大蛇丸， 大蛇丸了打消了奪取鼬寫輪眼和身體的念頭。
知道自己得不到鼬寫輪眼的大蛇丸只好把注意力打到了佐助身上， 在佐助沒有成長起來的時候就控制住了佐助， 並且開始培養佐助， 只要等到自己不屍轉生的術式好了之後就奪取佐助的身體和寫輪眼， 原本以為自己終於能夠得到佐助的身體和寫輪眼了， 可惜這一次的大蛇丸還是被佐助打敗了。
大蛇丸在整個火影劇情中的野心被多次阻止， 特別是多次敗在佐助和鼬這對兄弟， 後在第四次忍界大戰中， 看見藥師兜的失敗後改變了自己的想法， 最後在大戰中立功被洗白了。