耳穴療法已經被證明可治療的病種達200種， 這些病癥涉及內、外、婦、兒、五官、骨傷科， 不僅能夠治療功能性疾病， 而且可以治療器質性疾病， 以及病毒、細菌、寄生蟲等所致的疾病。
1、各種疼痛性疾病：耳穴療法最大特點是止痛， 對疼痛疾病有明顯療效。
2、各種炎癥性疾病：急性結膜炎， 牙周炎、中耳炎、咽喉炎、扁桃體炎、腮腺炎、胃炎、氣管炎、腸炎、膽囊炎、附件炎、盆腔炎、宮頸炎、風濕性關節炎等
3、變態反應性疾病及膠原組織疾病：過敏性鼻炎、過敏性結腸炎、蕁麻疹等
4、內分泌代謝及泌尿生殖系統等疾病：急性甲狀腺炎，
5、功能性疾病：內耳眩暈癥， 神經衰弱， 月經不調， 內分泌紊亂， 植物神經功能紊亂等
6、各種慢性疾病：腰腿痛、頸椎痛、肩背部肌纖維炎、慢性膽囊炎、慢性胃炎等
7、傳染性疾病：流感、百日咳、腮腺炎等
8、其他：催乳、暈車、暈船、戒煙、戒毒、解酒等， 還有保健、美容、減肥、排石等作用。